很多空调只有普通的滤网，过滤灰尘和防止霉菌生长的效果非常有限。所以灰尘和霉菌会堆积在空调的风道、热交换器、风扇上，而且大部分空调都有很多只能专业人员清洗的地方(市面上有很多空调清洗剂，但是这种方法不能把空调洗的很深，所以好处有限)。如果空调没有专人定期清洗(经常开空调的家庭，清洗间隔可能不到一年)，空调的空气质量反而会变差。很多用户不知道定期请人清洗室内空调，或者认为自己可以做到，导致空气质量下降，过敏和哮喘患病率增加。

　　当空调处于空调模式时，空调变脏的速度可能会加快，因为水会凝结在热交换器上。当空调关闭时，这些水会使霉菌更容易在空调内部生长。所以在空调关闭后，空调的风扇仍然需要开启至少几分钟，以干燥内部的水汽。大部分空调都有关闭空调后自动吹一段时间风的功能。

　　给空调加装静电过滤网甚至HEPA过滤网并定期更换，可以减少过敏原进入封闭环境，减少过敏问题。但是，由于空气往往会绕过过滤网，所以没有良好气密性设计的空调仍然需要经常清洗(空调过滤网的气密性设计非常重要，就像过滤效率和定期更换过滤网一样重要，有效的气密性设计可以保证所有进入空调的空气都得到过滤)。如果你想过滤有害气体，你需要添加活性炭过滤器或更有效的CPZ过滤器。

　　此外，二手烟毒性大，扩散快，不易过滤，会大大缩短过滤网的寿命。只有室内完全禁烟或室内吸烟区完全隔离(完全隔离的定义包括独立空调或不开空调、负压隔离和良好的尾气排放管理，社会学定义也要求吸烟区不应提供吸烟以外的功能)才能大大降低二手烟的危害，室外靠近门窗的地方也必须禁止吸烟。烧金纸、烧香、厨房油烟也是一样。但是，即使空气过滤设计得再好，空调系统造成的温度变化太大(比如从闷热的室外到凉爽的室内空间)，本身就有潜在的危险。空调被认为会引起哮喘(血管舒缩性哮喘或血管舒缩性鼻炎)，这是一种通常由气压或气温变化引起的反应。如果想减少温差带来的影响，要配合风扇使用，最好让整个空间都有微风。在微风下，同样的舒适度下还能提高温度，不仅更健康，还省电。

　　即使空调定期清洗，有很好的过滤系统，关好门窗还是会导致二氧化碳浓度上升，所以从外面引入空气很重要，最好引入过滤后的空气。为了减少通风造成的能量损失，全热交换器可用于引入室外空气。